锡林浩特六中建校于1993年8月，建校初期只有一栋教学楼，初高中8个教学班380名学生，办学规模小，办学条件差。经过三年的努力，学校被评为市级文明单位、锡市花园式学校，并通过了自治区“两基”达标验收。
    1997年，六中步入艰难的创业阶段，学校发展虽已初具规模，在校生已达2000多名，班容量平均70人左右，现有的办学条件已不能满足社会需求，学校急需改扩建。然而，当时锡盟社会经济发展相对落后，各级政府财力有限，学校筹措办学经费的渠道也相对狭窄。
    2000年，学校从银行贷款900万元，投入二期扩建工程，当年5月动工，仅用100天时间，近1万平方米的高中教学楼和学生公寓便矗立在六中校园，当年9月新学期开学即投入使用。紧接着又投入300多万元更新了教学设备，新建了8个理、化、生实验室，装备了3个现代化语音室，4个计算机网络教室，1个电教演播主控室，1个多媒体电教室，开通了计算机网、有线广播网、有线电视网、电话网，配齐配全了音、体、美、劳、科技等教学活动所用先进设施设备。当年，高中班从6个扩招到10个，初中班由4个扩招到6个。由于六中教学管理及办学条件在锡盟地区步入前列，成为本市及周边地区学生首选学校，致使六中校舍再次面临严重不足。
    2003年，学校启动了三期扩建工程，新建集科技实践、发明创造、仿真生态动植物园、矿物标本室、天文观测、多媒体网络教室、图书阅览和电子阅览等功能于一体的科技图书馆一座，建筑面积4052平米；新建1697平米的体育艺术馆一座；新建2770平米的3号高中教学楼一座。体育馆、科技馆及三号高中教学楼于2004年投入使用。至此，锡林浩特六中三期扩建后建筑面积达30000平米，使办学条件中的硬件建设达到了自治区示范性高中标准。
    2004年，根据全市学校布局结构调整规划，锡市职业中学并入六中，部分教师和一栋教学综合楼划归六中。2006年春季，锡市一中教师和学生全部并入六中。
    到2006年底，通过银行贷款等多种渠道累计筹措办学经费6000余万元，投入学校改扩建工程。已拥有初、高中部两个校区，教学、教辅楼13座，建筑面积4万多平方米，两个完整的校区办学条件均达到了全盟先进水平。办学规模发展到129个教学班，7600多名学生，503名教职工。实现了跨越式发展，成为锡盟地区规模最大，办学条件最好，教学质量最高的学校，跨入了内蒙古自治区文明单位和示范性高中行列。
    2008年，六中晋升为全国精神文明建设先进单位。
    2010年秋季，随着全市学校布局调整规划的实施，六中迁入新址。
    2011年12月，荣膺全国文明单位称号。
    2013年，六中历经20载拼搏进取，在改善办学条件，提高管理水平，加强师资队伍建设、校园文化建设和青少年学生思想道德建设等方面取得了具有开拓性的经验，创造了令人瞩目的办学业绩，得到了各级领导和全社会的认可，先后获得市级以上150余项集体荣誉，其中：
    锡盟级：爱国主义教育基地、锡盟社综治“长安杯”、锡盟师德师风建设先进单位、锡盟学校管理文化建设示范学校等；
    自治区级：自治区科技创新活动示范学校、自治区贯彻体育卫生条例先进学校、自治区家庭教育双合格单位、自治区先进基层工会、自治区五四红旗团委、自治区家庭教育工作先进单位、自治区现代教育技术优秀学校、自治区普通高中管理先进学校、自治区绿色学校、自治区示范性普通高中等；
    国家级：全国语言文字规范化示范学校、全国青少年科普教育示范学校、全国艺术教育先进学校、全国消防安全教育示范学校、全国精神文明建设先进单位、全国文明单位等。